根據(jù)《國(guó)務(wù)院辦公廳關(guān)于印發(fā)農(nóng)業(yè)部職能配置內(nèi)設(shè)機(jī)構(gòu)和人員編制規(guī)定的通知》（國(guó)辦發(fā)〔1998〕88號(hào)）精神和《農(nóng)業(yè)部關(guān)于調(diào)整部屬畜牧獸醫(yī)單位機(jī)構(gòu)編制的決定》（農(nóng)人發(fā)〔2006〕3號(hào)），農(nóng)業(yè)部于2006年4月5日批復(fù)了中國(guó)動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心主要職責(zé)、內(nèi)設(shè)機(jī)構(gòu)和人員編制。
中國(guó)動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心的主要職責(zé)是：協(xié)助獸醫(yī)行政主管部門擬定有關(guān)法律、法規(guī)和政策建議；協(xié)助開(kāi)展重大動(dòng)物衛(wèi)生違法案件的調(diào)查。研究提出重大動(dòng)物疫病（包括人畜共患病）預(yù)防控制規(guī)劃、撲滅計(jì)劃、應(yīng)急預(yù)案建議，指導(dǎo)、監(jiān)督重大動(dòng)物疫病預(yù)防、控制和撲滅工作，指導(dǎo)人畜共患病防治工作。研究提出動(dòng)物疫病防治技術(shù)規(guī)范建議，經(jīng)批準(zhǔn)后組織實(shí)施。負(fù)責(zé)全國(guó)動(dòng)物疫情收集、匯總、分析及重大動(dòng)物疫情預(yù)報(bào)預(yù)警工作；指導(dǎo)全國(guó)動(dòng)物疫情監(jiān)測(cè)體系建設(shè)；組織實(shí)施動(dòng)物疫病監(jiān)測(cè)工作，指導(dǎo)國(guó)家級(jí)動(dòng)物疫情測(cè)報(bào)站和邊境動(dòng)物疫情監(jiān)測(cè)站的業(yè)務(wù)工作。負(fù)責(zé)國(guó)家動(dòng)物防疫網(wǎng)絡(luò)信息系統(tǒng)、網(wǎng)絡(luò)溯源及應(yīng)急指揮平臺(tái)的建立及管理。承擔(dān)全國(guó)動(dòng)物衛(wèi)生監(jiān)督的業(yè)務(wù)指導(dǎo)工作，組織實(shí)施動(dòng)物及動(dòng)物產(chǎn)品檢疫。承擔(dān)全國(guó)高致病性動(dòng)物病原微生物實(shí)驗(yàn)室資格認(rèn)定及相關(guān)活動(dòng)的技術(shù)、條件審核等有關(guān)工作。承擔(dān)全國(guó)動(dòng)物病原微生物實(shí)驗(yàn)室生物安全監(jiān)督檢查工作；協(xié)調(diào)各級(jí)診斷實(shí)驗(yàn)室的疫情診斷工作。承擔(dān)動(dòng)物及動(dòng)物源性產(chǎn)品質(zhì)量安全檢測(cè)及其有關(guān)標(biāo)準(zhǔn)、標(biāo)物研制工作；承擔(dān)動(dòng)物標(biāo)識(shí)管理、動(dòng)物和動(dòng)物產(chǎn)品溯源工作。承擔(dān)動(dòng)物診療機(jī)構(gòu)和執(zhí)業(yè)獸醫(yī)的相關(guān)工作；承擔(dān)獸醫(yī)執(zhí)法人員的培訓(xùn)工作。負(fù)責(zé)獸醫(yī)行業(yè)職業(yè)技能鑒定工作。組織開(kāi)展動(dòng)物防疫技術(shù)研究、國(guó)際交流與合作等。
中國(guó)動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心業(yè)務(wù)歸口獸醫(yī)局管理，機(jī)構(gòu)規(guī)格為正局級(jí)。財(cái)政補(bǔ)助事業(yè)編制136名。局級(jí)領(lǐng)導(dǎo)職數(shù)5名。下設(shè)防控應(yīng)急處、獸醫(yī)公共衛(wèi)生處、疫情監(jiān)測(cè)處、動(dòng)物衛(wèi)生監(jiān)督指導(dǎo)處、實(shí)驗(yàn)室生物安全管理處、動(dòng)物產(chǎn)品安全檢測(cè)室、獸醫(yī)診斷室等12個(gè)業(yè)務(wù)處室和管理部門。
日前，中國(guó)動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心召開(kāi)了第一次職工大會(huì)。根據(jù)首批進(jìn)入疫控中心人員的情況，調(diào)配了各部門工作人員，部署了工作。
